En annen av institusjonene i kaffeforeningen som fortjener å bli fremhevet og som spiller en grunnleggende rolle i bevaringen av PCCC, er Nasjonalt forskningssenter for Kafé, Cenicafe.

Dette er regnes som forskningssenteret til kaffe viktigst i Colombia og verden. Den ble opprettet i 1938 og har ansvaret for å generere kunnskap og ny teknologi til fordel for kaffedyrkere over hele landet. Takket være det ovennevnte har PCCC-produsenter klart å implementere mer effektive, produktive og bærekraftige kultivarianter og -metoder.  Hovedkontoret ligger i Manizales kommune, avdelingen i Caldas.